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Oggetto Discussione: calcolatore genetico cocorite Inserisci rispostaInserisci nuova discussione
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matteoforte
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Postati: 24 luglio 2012 at 18:31 | IP Logged Quota matteoforte

Ragazzi mi sapete indicare un calcolatore genetico per le cocorite. Lo so che ci sono stati già dei thread aperti a questo proposito però ho cercato sul programma cerca di questo forum ed ho trovato tutto solo sulle calospiti !

Comunque visto che sono quasi tutti se non tutti in inglese, ed io con l'inglese ancora bè... non ssono granché se mi daste una breve spiegazione ne sarei felice! Grazie

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Bartolo
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Postati: 24 luglio 2012 at 18:36 | IP Logged Quota Bartolo

Matteo guarda che senza usare cerca di di calcolatori potevi trovarne due nella
discussione "Calcolatore genetico" di .Silvia c'è un link a quello che uso io, più un
altro con molte altre specie, entrambi purtroppo in inglese, ma se hai qualche dubbio puoi
chiedere a me. Mi riferisco a quello che uso io naturalmente... quello so usarlo al 100%.

__________________
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matteoforte
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Postati: 24 luglio 2012 at 18:47 | IP Logged Quota matteoforte

a è vero scusa non avevo visto, adesso lo provo e se ho problemi ti chiederò grazie

Ok allora, una volta entrati che bisogna fare?

Scusa è che ho proprio bisogno di aiuto!



Modificato da matteoforte on 24 luglio 2012 at 18:50
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Bartolo
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Postati: 24 luglio 2012 at 22:46 | IP Logged Quota Bartolo

Stai usando questo, vero?

http://www.gencalc.com/gen/eng_genc.php?sp=0Budg

Se sì, provo a illustrarti come funziona in generale, se poi hai dubbi in particolare non
esitare a chiedere!
Allora appena entri noti una tabella formata da varie colonne, le prime sono:
-symbol, in cui è indicato il simbolo internazionale dell'allele della mutazione
-mutations, in cui compare il nome inglese della mutazione
-inheritation mode, che indica il comportamento genetico della mutazione

In merito a questo punto, sul fondo puoi leggere per esteso il significato delle
abbreviazioni, per comodità te le traduco:
-re: autosomico recessivo (vale a dire recessivo non legato al sesso, come il blu,
l'alagrigia, l'alachiara, il diluito...)
-se: recessivo sessolegato (come l'ino, l'opale, il cannella...)
-do: autosomico dominante (mutazioni a dominanza completa come il grigio)
-in: autosomico dominante incompleto (ovvero che differiscono tra singolo e doppio
fattore, come lo spangle, lo scuro, il viola...)
Cose a cui puoi non fare caso:
Puoi trovare "ld" a fianco alla mutazione crest in quanto è talvolta letale, ma il suo
comportamento genetico non è ancora del tutto chiaro. Infine con il simbolo |_ vengono
indicate le serie polialleliche e le indicazioni sono relative, ad esempio puoi leggere "cd"
tra alagrigia e alachiara, anche se dominano sul diluito ma sono recessive rispetto
all'ancestrale... Roba complicata che ti consiglio, almeno per il momento, di ignorare.

Parliamo di come si usa. Dopo queste tre colonne ci sono due grandi raggruppamenti,
uno è 1.0 (maschio) e l'altro è 0.1 (femmina). Sinceramente non so perchè abbiano
scritto così e non male/female... Boh, comunque ricordati che in un accoppiamento si
indica sempre prima il maschio, quindi si comincia da lui.

Sia per il maschio che per la femmina abbiamo la colonna Visual (mutato) e Splits to
(portatore). La colonna visual è divisa a sua volta in df e sf, ovvero doppio e singolo
fattore, distinzione valida solo per le mutazioni dominanti (do e in), per le recessive è
sottinteso che si df perchè altrimenti non abbiamo più un mutato ma un portatore, e
quindi saremmo nella colonna Splits to, che ovviamente si applica solo alle mutazioni
recessive (re e se).

Nel caso delle recessive sessolegate (se) abbiamo, per i maschi, una divisione della
colonna Split in X1 e X2 che serve a collocare sul corretto cromosoma X la mutazione (è
diverso indicare un portatore di opale e cannella da un portatore di opale-cannella: nel
primo caso devi metterli su X distinte, nel secondo caso sulla stessa X). Questa
distinzione ovviamente non si ha per le femmine in quanto non possono essere portatrici
di mutazioni sessolegate, avendo solo un X.

A questo punto non devi far altro che segnare i pallini delle mutazioni, e poi premere il
pulsante "Generate" in fondo, ti compariranno i risultati della prole con le relative
percentuali, distinti tra maschi e femmine.

Se sbagli devi premere il pulsante "Reset"... Che però cancella tutto, cerca di non
sbagliare proprio alla fine o dovrai rimettere tutto da capo! È l'unico difetto di questo
calcolatore che però io trovo molto pratico e completo.

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matteoforte
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Postati: 25 luglio 2012 at 13:12 | IP Logged Quota matteoforte

Ok grazie ora provo

<ok grazie ci sono riuscito



Modificato da matteoforte on 25 luglio 2012 at 13:21
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Bartolo
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Postati: 25 luglio 2012 at 13:35 | IP Logged Quota Bartolo

Perfetto... se dovessi avere dubbi chiedi pure!

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sanny
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Postati: 25 luglio 2012 at 14:50 | IP Logged Quota sanny

x Bartolo:il calcolatore genetico si puo' utilizzare anche nel caso in cui il maschio sia portatore di diverse mutazioni?Per esempio:cannella/opale,ala merlettata e blu x ala merlettata.

__________________
      
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.Silvia
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Postati: 25 luglio 2012 at 15:02 | IP Logged Quota .Silvia

Bartolo spiegazione utilissima

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Bartolo
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Postati: 25 luglio 2012 at 15:19 | IP Logged Quota Bartolo

Il maschio del tuo accoppiamento essendo mutato cannella trasmetterà alla prole o il
cannella-opale o il cannella-ino (ala merlettata). Dunque da questa coppia secondo me
dovresti ottenere:
-maschio verde cannella/cannella-opale/cannella-ino (ala merlettata)
-maschio verde/blu cannella/cannella-opale/cannella-ino
-maschio verde ala merlettata
-maschio verde/blu ala merlettata
-femmina verde cannella-opale
-femmina verde/blu cannella-opale
-femmina verde ala merlettata
-femmina verde/blu ala merlettata
Più altre stranezze dovute al crossing over che non riesco a prevedere (ino, opale,
cannella, anche ala merlettata opale, wow...)

Ho provato a inserire i dati nel calcolatore ottenendo i seguenti risultati:

% from all 1.0
7.5%      1.0 ino cinnamon /opaline
7.5%      1.0 ino cinnamon /blue opaline
17.5%1.0 ino cinnamon
17.5%1.0 ino cinnamon /blue
7.5%      1.0 green cinnamon /ino
7.5%      1.0 green cinnamon /blue ino
17.5%1.0 green cinnamon /opaline ino
17.5%1.0 green cinnamon /blue opaline ino
% from all 0.1
17.5%0.1 green opaline cinnamon
17.5%0.1 green opaline cinnamon /blue
7.5%      0.1 green cinnamon
7.5%      0.1 green cinnamon /blue
17.5%0.1 ino cinnamon
17.5%0.1 ino cinnamon /blue
7.5%      0.1 opaline ino cinnamon
7.5%      0.1 opaline ino cinnamon /blue

Penso che abbia applicato il COV tra ino, cannella e opale... Tra ino e cannella è molto più
basso che tra ino e opale, nel primo caso se non ricordo male siamo intorno al 4%, nel
secondo intorno al 30%.

Comunque per rispondere alla tua domanda sì, si possono inserire le varie mutazioni
sessolegate e nel caso dei maschi si deve scegliere il cromosoma X su cui esse sono
collocate.

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